Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (all genders)

Wir sind das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE) – und stehen für exzellente Kompetenz in Forschung, Lehre und der vollumfänglichen Gesundheitsversorgung in unseren Kliniken. Unsere rund 15.300 Mitarbeiter:innen streben jeden Tag aufs Neue danach, mit ihrem Beitrag die Welt ein bisschen gesünder zu machen.
 
Es ist unser Anspruch, eine der führenden Universitätskliniken zu sein – und gleichzeitig der beste Arbeitgeber unserer Branche. So glauben wir im UKE fest daran, dass erfolgreiches und erfüllendes Arbeiten im Einklang mit den persönlichen Bedürfnissen und individuellen Lebensentwürfen der Mitarbeitenden stehen sollte. Und so unterschiedlich diese sind, so vielfältig ist unser Angebot an individuellen Lösungen.

Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (all genders) für den Bereich Bioinformatik – Metagenomik/Virusgenomik

Einsatzbereich: Die Position ist in dem DFG-Sonderforschungsbereich (SFB) 1648 „Neu auftretende Viren: Pathogenese, Struktur, Immunität“ integriert, der sich mit neu auftretenden Virusinfektionen und ihrer Bedeutung für die globale Gesundheit auseinandersetzt. Das neu gegründete CRC 1648 zielt darauf ab, ein tiefes Verständnis der Virus-Wirt-Interaktionen, der Struktur, der Pathophysiologie und der Immunität gegen bestimmte neu auftretende Virusinfektionen zu erlangen. Für das Teilprojekt - Metagenomik in neu auftretenden Virusinfektionen - wird eine Mitarbeit mit ausgewiesener bioinformatischer Expertise gesucht. Das Projekt befasst sich mit dem Pathogennachweis in Sequenzdaten, mit der Integration von Pathogen-und Wirtstranskriptomdaten zur verbesserten Vorhersage von Infektionskrankheiten. Das Teilprojekt wird in der Arbeitsgruppe von Frau Prof. Dr. Nicole Fischer lokalisiert sein.

Ihren Aufgaben:

• Analyse und Interpretation von Next-Generation-Sequencing (NGS)-Daten und anderen molekularbiologischen Datensätzen
• Bearbeitung von Forschungsprojekten zur Entwicklung von Metagenomik Software Platformen in der Infektionsdiagnostik
• Entwicklung, Implementierung und Validierung von Bioinformatik-Pipelines zur Verarbeitung und Visualisierung großer Datenmengen
• Automatisierung von Workflows und Datenverarbeitungsprozessen zur Steigerung der Effizienz
• Etablierung aktueller NGS basierter Biomarker in der Routinediagnostik

Diese Position ist im Rahmen des Sonderforschungsprojektes vorerst bis zum 30.06.2028 befristet. Eine Verlängerung ist avisiert.

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium der Bioinformatik oder eines verwandten Studienfaches
• Verhandlungssichere Deutschkenntnisse und gute Englischkenntnisse
• Kenntnisse in den Bereichen Sequenzanalyse, Virusgenomik, Skriptsprachen
• Fundierte Kenntnisse in der Analyse von NGS Daten und anderen molekularen Technologien
• Kenntnisse in der Anwendung und Entwicklung von Bioinformatik-Software sowie von Datenbanken (z. B. Ensembl, COSMIC, dbSNP)
• Solide Linuxkenntnisse
• Interesse an Virologie, Mikrobiologie und molekularer Diagnostik
• Engagement, Koordinations- und Organisationsgeschick, schnelle Auffassungsgabe, Selbständigkeit, Teamfähigkeit und sehr gute Kommunikationsfähigkeit

Immunitätsstatus

Eine Einstellung ist nur möglich, wenn nach den jeweils geltenden (gesetzlichen und medizinischen) Vorgaben gegen das Masernvirus ein vollständiger Immunisierungs- bzw. Immunitätsnachweis vorliegt. Dies ist vor Beschäftigungsbeginn durch entsprechende Unterlagen (z.B. Impfausweis) nachzuweisen.

• Attraktive Bezahlung nach TVöD/VKA
• Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander
• Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team
• Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere
• Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten
• Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
• Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
• Unser Mitarbeitendenrestaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände